La vida del Seminario se caracteriza por los siguientes valores:

1. Con la comunidad: Sabiduría, credibilidad, compromiso cristiano, excelencia administrativa, respeto a la vida y la naturaleza, y pasión por la justicia y la paz.
2. Con el estudiantado e iglesias: Liderazgo académico y ministerial, profesionalismo, consagración, espíritu de servicio y buen testimonio.
3. Con los empleados y colaboradores: Respeto, integridad, compañerismo, motivación, participación y lealtad.
4. Con todos: Compromiso profético, vocación sacerdotal, dignidad, calidad y espíritu de fe, amor y esperanza.