Acreditación
El Seminario Evangélico está organizado sobre bases similares a las de otras instituciones de alta categoría académica y profesional. Es miembro acreditado de:
- Asociación de Escuelas Teológicas en los Estados Unidos y el Canadá
- Asociación Latinoamericana de Instituciones de Educación Teológica.
Además, está acreditado por:
- Commission on Higher Education of the Middle States Association of Colleges and Schools.
- Association of Theological Schools
El programa de M.A.R. cuenta con la debida licencia del Consejo de Educación Superior de Puerto Rico.
Gobierno
El Seminario Evangélico de Puerto Rico es gobernado por una Junta de Directores compuesta de treinta y cuatro miembros, todos nombrados por la Junta misma. Dieciocho son nominados por las seis denominaciones auspiciadoras, tres por cada una. De estas tres personas, dos representan la unidad o judicatura de la iglesia local en Puerto Rico, mientras que la tercera representa la junta misionera auspiciadora en los Estados Unidos. Dieciséis de los miembros son nominados por el Comité de Nominaciones de la propia Junta.La Asociación de Graduados y Ex Alumnos y el cuerpo estudiantil cuentan con representación en la Junta de Directores. El Presidente del Seminario es miembro «ex oficio». La Junta de Directores tiene su sede legal en el Seminario Evangélico en San Juan y es la autoridad final en todos los asuntos de política institucional.